La detección de virus en aguas residuales mediante análisis moleculares permite la vigilancia epidemiológica de enfermedades transmitidas por vía fecal-oral, como las causadas por virus entéricos, o virus que se excretan en las heces y orina, como es el caso del SARS-CoV-2.
La detección de ARN del SARS-CoV-2 mediante técnicas moleculares en aguas residuales, alcantarillas y lodos ha demostrado su potencial como herramienta de alerta temprana y puede utilizarse como indicador epidemiológico de nuevas variantes emergentes. Asimismo, la vigilancia de norovirus, virus de la hepatitis A, virus de la hepatitis E y rotavirus en aguas residuales es útil para evaluar su nivel de circulación en la población, así como para proporcionar información sobre los tipos o variantes circulantes.
